本系的設立奠基於校與院的架構體系上,以「培育理論與實務兼備之機械工程人才」為教育宗旨。以機械原理、知識、及技術之傳授,培養學生之專業根底;以電腦輔助科技、實驗、和實作加深學生認識理論及其用途;教學融入趣味、應用、與挑戰等元素以誘發學生創意潛能;鼓勵順性發展,善用本校多元學系的特點,修習輔系雙學位,培養學生跨領域整合之才能。
成立宗旨主要在有效整合工學院電機工程學系、機械工程學系及資訊工程學系三系之資源,投入數位機電科技之研究及應用工作,培育高階之數位與機電跨領域整合之科技人才,以支援附近科技園區產業之發展。
98學年度併入機械工程學系,更名為「機械工程學系數位機電碩士班」,其方向也更聚焦於機電整合與控制技術之發展。